Para entender por qué la hemofilia afecta principalmente a los individuos varones tenemos que entender antes como se llega a tener esta enfermedad.

La producción del factor VIII de coagulación depende de un gen localizado en nuestros cromosomas. Nuestra maquinaria intra-celular es la responsable de leer las instrucciones que están escritas en este gen (código genético) y,  basándose en estos, de producir el factor.

En el enfermo hemofílico estas instrucciones contienen algunos errores y por lo tanto la célula no consigue producir correctamente el factor VIII. Que el factor VIII de coagulación sea defectuoso implica que la coagulación no se pueda llevar a cabo adecuadamente.

El gen del factor VIII se encuentra localizado en el cromosoma sexual X. Las mujeres tienen dos copias de este cromosoma ya que heredan una copia de la madre y una del padre mientras que los hombres tienen solo una copia del cromosoma X ya que del padre no heredan este cromosoma sino el cromosoma Y, que es característico y exclusivo de los varones.

Si una mujer tiene un cromosoma X que contiene el gen del factor VIII defectuoso pero en el otro cromosoma el gen del factor VIII es normal, no va a padecer hemofilia ya que una sola copia del gen es suficiente para producir la cantidad necesaria de factor VIII para un correcto proceso de coagulación. Esta mujer será sana pero portadora de la enfermedad.

Si un hombre tiene, en cambio, un cromosoma X que contiene el gen del factor VIII defectuoso, SÍ va a padecer hemofilia ya que no tiene ninguna otra copia del gen que sea capaz de producir factor VIII normal (el cromosoma Y no contiene ninguna copia del gen del factor VIII).

Para acabar, pensemos en el ejemplo ilustrado en la imagen anterior en la que la mujer es portadora sana (tiene una copia X que contiene el factor VIII defectuoso y una copia X que contiene el factor VIII normal) de la enfermedad mientras que el hombre es un individuo sano (tiene una sola copia X que contiene el factor VIII sano). Si esta pareja tuviera una hija, esta podría ser completamente sana (caso 1), si recibiera la copia X sana de la madre y la copia X sana del padre; también podría ser portadora sana (caso 2), si recibiera la copia X defectuosa de la madre y la copia X sana del padre pero en ningún caso padecería la enfermedad. Si la pareja tuviera un hijo, este recibiría siempre la copia Y del padre (que no contiene el gen para el factor VIII) y, si recibiera la copia X sana de la madre el niño sería completamente sano (caso 3) mientras que si la copia X heredada de la madre fuera la copia defectuosa, el niño padecería hemofilia (caso 4).